Epidemiological profile and follow-up of patients with pulmonary disease by non-tuberculous mycobacteria in Baixada Santista area, São Paulo

ABSTRACT Objective To present the frequency and species diversity of non-tuberculous mycobacteria, estimate the prevalence of non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease, describe the epidemiological profile, and determine the follow-up of patients with non-tuberculous mycobacterial pulmonary disease living in a region with a high burden of tuberculosis. Methods This a retrospective cohort observational study using data records obtained from the Instituto Adolfo Lutz - Santos and from the São Paulo Sistema de Vigilância de Tuberculose do Estado de São Paulo in the period between 2000 and 2009. The studied variables were: socio-demographic characteristics, current and past history of tuberculosis, aspects related to diagnosis, and treatment and associated diseases. Results We included 319 non-tuberculous mycobacteria isolates in the study, corresponding to 257 patients. The species Mycobacterium kansasii (28.5%) and Mycobacterium fortuitum (16.6%) presented the higher occurrence. In 10.9% (24) of the patients, there was a criterion for confirming a case of pulmonary disease due to non-tuberculous mycobacteria. In relation to gender and age, male and individuals over 50 years old were the most frequent. Considering the confirmed cases, 47.8% had a past history of tuberculosis. Conclusion The lack of information about the cases is evident, since pulmonary disease due to non-tuberculous mycobacteria is not mandatory. The therapeutic regimen according to the identified species is fundamental for success in combating the infections caused by non-tuberculous mycobacteria. Besides that, information about the regional epidemiology of pulmonary disease caused by non-tuberculous mycobacteria and the search for associations with other comorbidities are important to establish the correct treatment. In order to improve surveillance of pulmonary diseases by non-tuberculous mycobacteria, we suggest the implantation of a sentinel surveillance and of population-based studies.

Caracterização molecular das cepas de Streptococcus pneumoniae do sorotipo 1, isoladas de pacientes com doença invasiva no Brasil em três décadas, 1977 - 2005 / Molecular characterization of strains of the streptococcus pneumoniae serotype 1, isolated of disease invasive in Brazil in three decade, 1977 - 2005

Streptococcus pneumoniae ou pneumococo é o principal agente etiológico das pneumonias adquiridas na comunidade, um dos mais freqüentes agentes de meningites e bacteremias, como também é causa importante de otites médias e sinusites. Com a alta prevalência do pneumococo sorotipo 1 no Brasil, e a não inclusão deste sorotipo na vacina pneumocóccica conjugada, somados à descrição de clones internacionais pertencentes a este sorotipo, justificam-se os estudos de caracterização molecular de cepas desse sorotipo. O presente estudo teve como objetivo avaliar as cepas de pneumococo sorotipo 1 isoladas de 1977 a 2005 em diferentes regiões do Brasil por metodologia molecular e comparar os padrões dos clones internacionais reconhecidos pela rede mundial “Pneumococcal Molecular Epidemiology Network” (PMEN). Um total de 134 cepas de pneumococo sorotipo 1 isoladas de pacientes com diferentes faixas etárias e diagnósticos clínicos foram estudadas. As cepas foram selecionadas a partir da coleção de cepas do Setor de Bactérias Piogênicas e Toxigênicas, do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo. Os sorotipos foram determinados pela reação de Quellung utilizando antisoros policlonais (“Staten Serum Institute”, Dinamarca). Para tipagem molecular utilizou-se a eletroforese em campo pulsado dos fragmentos de DNA, após digestão com SmaI, e os perfis eletroforéricos foram analisados conforme os critérios de Tenover et al., 1995. A similaridade genética entre as linhagens de cepas foi calculada através da construção de dendrogramas. Foram identificados 2 tipos genéticos denominados A (70,2%) e B(29,8%). Entre as cepas do tipo A, observou-se os subtipos A1 (4,3%), A2 (2,1%), A3 (92,5%) e A4 (1,1%); entre as cepas do tipo B observou-se ossubtipos B1 (2,5%), B2 (27,5%), B3 (10,0%), B4 (27,5%), B5 (2,5%), B6 (5,0%), B7 (5,0%), B8 (17,5%) e B9 (2,5%). A similaridade genética entre as cepas do tipo A foi de 85,53% e entre as cepas do tipo B foi de 84,25%. A similaridade do subtipo A3 com os sub...

Caracterização molecular das cepas de Streptococcus pneumoniae do sorotipo 1, isoladas de pacientes com doença invasiva no Brasil em três décadas, 1977 - 2005

Streptococcus pneumoniae ou pneumococo é o principal agente etiológico das pneumonias adquiridas na comunidade, um dos mais freqüentes agentes de meningites e bacteremias, como também é causa importante de otites médias e sinusites. Com a alta prevalência do pneumococo sorotipo 1 no Brasil, e a não inclusão deste sorotipo na vacina pneumocóccica conjugada, somados à descrição de clones internacionais pertencentes a este sorotipo, justificam-se os estudos de caracterização molecular de cepas desse sorotipo. O presente estudo teve como objetivo avaliar as cepas de pneumococo sorotipo 1 isoladas de 1977 a 2005 em diferentes regiões do Brasil por metodologia molecular e comparar os padrões dos clones internacionais reconhecidos pela rede mundial “Pneumococcal Molecular Epidemiology Network” (PMEN). Um total de 134 cepas de pneumococo sorotipo 1 isoladas de pacientes com diferentes faixas etárias e diagnósticos clínicos foram estudadas. As cepas foram selecionadas a partir da coleção de cepas do Setor de Bactérias Piogênicas e Toxigênicas, do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo. Os sorotipos foram determinados pela reação de Quellung utilizando antisoros policlonais (“Staten Serum Institute”, Dinamarca). Para tipagem molecular utilizou-se a eletroforese em campo pulsado dos fragmentos de DNA, após digestão com SmaI, e os perfis eletroforéricos foram analisados conforme os critérios de Tenover et al., 1995. A similaridade genética entre as linhagens de cepas foi calculada através da construção de dendrogramas. Foram identificados 2 tipos genéticos denominados A (70,2%) e B(29,8%). Entre as cepas do tipo A, observou-se os subtipos A1 (4,3%), A2 (2,1%), A3 (92,5%) e A4 (1,1%); entre as cepas do tipo B observou-se ossubtipos B1 (2,5%), B2 (27,5%), B3 (10,0%), B4 (27,5%), B5 (2,5%), B6 (5,0%), B7 (5,0%), B8 (17,5%) e B9 (2,5%). A similaridade genética entre as cepas do tipo A foi de 85,53% e entre as cepas do tipo B foi de 84,25%. A similaridade do subtipo A3 ...